1999年6月2日，经北京市政府批准，由北京住总作为主发起人，联合北京市国有资产经营公司、北京市新技术产业发展服务中心、北京实创高科技发展总公司、联想集团股份公司、北京北大方正集团公司和四通公司共同发起设立“北京中关村科技发展股份有限公司”，郝有诗当选为公司董事长。

1999年7月12日，公司在深圳证券交易所挂牌上市，代码0931，简称"中关村"。

1999年8月27日，段永基出任公司总经理。

1999年9月15日， 1999年度第一次临时董事会议通过《合作开发建设"中关村科技发展大厦"的议案》（现名称为“中关村科技贸易中心”），项目总投资预计13.5亿元人民币，由本公司筹措解决，意隆达集团与海龙集团以场地作为合作条件。

1999年12月28日， 董事会通过设立"北京中关村青年科技创业投资有限责任公司"的议案；通过收购北京四环制药厂的议案。

2000年1月20日，公司在昌平召开公司学习发展研讨会。公司确立了信息通信、开发建设、生物医药和金融投资四业并举战略格局。

2000年3月3日，公司名称变更为“北京中关村科技发展(控股)股份有限公司”;公司决定出资2.766亿元与北京国城经济技术发展有限公司联合开发"北京白石桥科技综合楼"。

2000年6月22日，北京四环医药科技股份有限公司创立大会在北京四环制药厂召开。

2000年7月10日， 举行北京中关村开发建设股份有限公司成立仪式。

2000年9月8日， 公司总部进驻中关村科技发展大厦。

2001年2月21日， 第一届董事会2001年度第二次临时会议选举袁振宇为公司董事长。

2001年10月23日，召开公司发展战略研讨会，针对最近公司企业形象调查报告所提出的“市场形象不清晰”问题进行了充分讨论，并确立了以“全面电信增值服务业务”为主营业务的发展方向。

2002年6月6日，  中关村科技软件有限公司在新落成的中关村软件园举行了隆重的新址揭牌仪式。

2002年6月9日， "中关村科技贸易中心"正式开盘。

2003年9月30日，北京2008年奥运会比赛场馆—北京五棵松文化体育中心项目法人招标签约仪式在大运村科园酒店举行，中关村建设公司联合体被确定为中标人。

2003年12月15日，中关村科技贸易中心举行竣工庆典仪式。

2004年1月9日，中关村科技第二届董事会2004年度第一次临时会议选举张贵林先生为公司董事长。

2004年2月21日，中关村科技贸易中心举行了开业典礼。

2004年4月27日，公司股票实施股票交易退市风险警示和特别处理，股票简称变更为*ST中科。

2005年5月13日，撤销股票退市风险警示和特别处理，股票简称恢复为“中关村”。

2006年4月10日，鹏泰投资与北京市国有资产经营有限责任公司签署《国有法人股转让协议》。

2006年5月16日，召开第三届董事会2006年度第三次临时会议，董事会同意现任总经理段永基先生辞去总经理职务，聘任王会生先生担任总经理职务。

2006年6月5日，公司获国务院国有资产监督管理委员会下达国资产权〔2006〕616号《关于中关村科技发展（控股）股份有限公司部分国有股权转让有关问题的批复》，同意海源控股和鹏润投资对公司的重组方案。

2006年7月20日，北京住总与鹏泰投资、粤文音像、海源控股重新签订股份转让协议。分别受让住总集团持有的中关村27.51%股份，7.5%股份、5%的股份。

2006年9月25日，公司收到国务院国资委关于公司股权重组方案的批复意见，进入股权分置改革工作程序。

2006年11月30日-12月4日股改网络投票，12月4日召开现场股东大会，12月6日公告投票结果，以76.35%的同意率通过股改方案，最终完成股权重组和股权分置改革工作。